过滤器滤芯长期不用，必须把滤器清洗干净、滤芯拔下，洗净烘干，用塑料袋封口存放不要污染，滤器擦净存放，不要损坏。
换下来的滤芯要浸泡在酸碱洗液里，浸泡时间不要超过24小时，酸碱液温度一般在25℃—50℃。建议酸或碱与水比时10-20％为好。蛋白质含量较高的滤液、滤芯用酶溶液浸泡，清洗效果好，更新再使用，要清洗干净再用蒸汽消毒，清洗消毒对水过滤器和干燥过滤器很重要。
滤芯消毒要注意掌握时间和温度，聚丙烯在高温度消毒柜里以121℃为宜，用蒸汽消毒在0.1mpa蒸汽压力下，以130℃/20分钟为宜，聚砜和聚四氟乙烯用蒸汽消毒，可以达到142℃、压力0.2mpa，时间30分钟左右为宜，如果温度过高，时间过长，压力过大，会损坏滤芯。